SARS-CoV-2: CRISPR-Screen enthüllt kritische Wirtsfaktoren

SARS-CoV-2 (COVID-19) ist eine große Bedrohung der öffentlichen Gesundheit mit mehr als 1.200.000 Todesfällen weltweit. Das erste Stadium im Lebenszyklus des Coronavirus ist der virale Eintritt, bei dem das virale Spike-Protein an einen spezifischen Zelloberflächenrezeptor bindet. Die Spike-Proteine von SARS-CoV-2 sowie von SARS-CoV-1 und NL63 nutzen Angiotensin-Converting Enzyme 2 (ACE2) als Rezeptor zur Bindung. Ein Antikörper für dieses ACE2-Protein wurde von ProSci Inc. hergestellt, der sich in Immunhistochemie- und Immunfluoreszenzexperimenten an menschlichen Proben und in Western-Blot-Experimenten an menschlichen, Maus- und Rattenproben als funktionsfähig erwiesen hat (Artikel Nr. 3217).

Ein genomweiter CRISPR-Screen mit SARS-CoV-2, MERS-CoV, einem Coronavirus, das das Spike-Protein von SARS-CoV-1 expremiert, und einem vesikulären Stomatitis-Virus, das das Spike-Protein von SARS-CoV-2 expremiert, wurde von einem Labor der Yale University durchgeführt, um Wirtsfaktoren zu finden, die für die Infektion mit SARS-CoV-2 kritisch sind (Wei et al, Cell, 2020).
Graphical Abstract – Wei et al., Cell, 2020

Anti-ACE2-Antikörper (3217) von ProSci Inc. wurden in der jüngsten Studie mit KO- und Regulationsvalidierung verwendet (Wei et al, Cell, 2020). Ein genomweiter CRISPR-Screen mit SARS-CoV-2, MERS-CoV, einem Coronavirus, das das Spike-Protein von SARS-CoV-1 exprimiert, und einem vesikulären Stomatitis-Virus, das das Spike-Protein von SARS-CoV-2 exprimiert, wurde von einem Labor der Yale University durchgeführt, um Wirtsfaktoren zu finden, die für die Infektion mit SARS-CoV-2 kritisch sind (Wei et al, Cell, 2020).

In dieser Studie wurden 14 Gene, darunter ACE2 und SMARCA4, in den Viren der SARS-Linie, aber nicht in MERS-CoV gefunden, was darauf hindeutet, dass diese Gene von den SARS-Viren beim Wirtseintritt verwendet werden. ACE2, HMGB1, SMARCA4 und andere Gene wurden in beiden Zelllinien mit einer pro-viralen Funktion gefunden, was den Schluss zulässt, dass die Funktion dieser Gene artübergreifend konserviert ist. Die SMARCA4-Untereinheit des SWI/SNF-Remodeling-Komplexes war der zweitstärkste Treffer bei SARS-CoV-2-Viren, wobei ACE2 der stärkste Treffer war.

Der SWI/SNF-Komplex ist ein Remodeling-Komplex, der die Zugänglichkeit von Chromatin und die Genexpression reguliert. Knockout-Experimente von ACE2 und SMARCA4 zeigten beide eine Abnahme der Proteinabundanz, die mit einem erhöhten Schutz gegen SARS-CoV-2 korreliert war. Es konnte gezeigt werden, dass kleine Molekül-Antagonisten des SMARCA4-Proteins den Schutz vor dem virusinduzierten Zelltod verstärken und gleichzeitig die Frequenz der Virusinfektion verringern. In diesem genetischen Screening wurde festgestellt, dass das HMGB1-Gen für die ACE2-Expression notwendig ist. HMGB1-Knockout-Zellen zeigten eine signifikante Reduktion des ACE2-Proteins mittels Western-Blot-Analyse und eine verminderte Anfälligkeit für SARS-CoV-2-Infektionen.


Antikörper gegen das SARS-CoV-2 Resistenzgen

ArtikelArtikelNr.HostMengen
ACE2 Antibody3215-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
ACE2 Antibody3217-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
ACE2 Antibody3227-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
ACE2 Antibody3229-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
ArtikelArtikelNr.HostMengen
HMGB1 Antibody7715-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
HMGB1 Antibody [1D5]51-465Mouse0.05 mg
HMGB1 Antibody [2F6]51-467Mouse0.05 mg
HMGB1 Antibody18-706-50Rabbit50 uL
HMGB1 Antibody13-264-100Rabbit100 uL
ArtikelArtikelNr.HostMengen
CTSL Antibody14-312-50Rabbit50 uL
CTSL Antibody14-245-50Rabbit50 uL
ArtikelArtikelNr.HostMengen
SMARCA4 Antibody7749-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
SMARCC1 Antibody22-018-50Rabbit50 uL
DYRK1A Antibody6255-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg, 0.5 mg, 1 mg
KDM6A Antibody23-439-50Rabbit50 uL
ARID1A Antibody8173-Rabbit0.02 mg, 0.1 mg

Falls Sie mehr über dieses Thema erfahren wollen, lesen Sie doch ein wenig über den SRAS-CoV-2 bedingten Zytokinsturm.

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